Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMP1P11279 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms