Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms