Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms