Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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