Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QRK9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QRK9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QRK9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QRK9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms