Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GGTLC3B5MD39 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms