Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDR42E2A6NKP2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms