Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3M1Q9Y2T2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms