Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms