Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms