Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms