Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF304Q9HCX3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms