Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms