Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HINFPQ9BQA5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HINFPQ9BQA5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms