Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms