Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BICD1Q96G01 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms