Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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