Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms