Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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