Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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