Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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