Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HERC3Q15034 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HERC3Q15034 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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