Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SMCO1Q147U7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SMCO1Q147U7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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