Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H3Q13889 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms