Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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TRAF1Q13077 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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