Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms