Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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