Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms