Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB15P59190 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB15P59190 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB15P59190 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms