Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGDP52209 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGDP52209 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGDP52209 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms