Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK1EP49674 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms