Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NESP48681 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NESP48681 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NESP48681 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NESP48681 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NESP48681 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms