Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH1P12830 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH1P12830 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CDH1P12830 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms