Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM8Q9NQV8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms