Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMURF2Q9HAU4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms