Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms