Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms