Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ZNF226-204ENST00000454662 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PRAC1Q96KF2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms