Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STAMBPL1Q96FJ0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms