Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTF18Q8WVB6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CHTF18Q8WVB6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CHTF18Q8WVB6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CHTF18Q8WVB6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CHTF18Q8WVB6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CHTF18Q8WVB6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CHTF18Q8WVB6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CHTF18Q8WVB6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTF18Q8WVB6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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