Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP54Q7Z3B4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms