Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL6Q6ICC9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RTL6Q6ICC9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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