Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf135Q5VTT2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms