Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms