Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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