Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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PMCHL1Q16048 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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