Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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