Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PUM3Q15397 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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