Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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