Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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